Моніторинг сайтів інтеграції векторів у підходах генної терапії in vivo шляхом секвенування рідкої біопсії і інтеграції сайтів

Основні моменти 28-го щорічного конгресу ESGCT

Моніторинг сайтів інтеграції векторів у підходах генної терапії in vivo шляхом секвенування рідкої біопсії і інтеграції сайтів

Д Чезана¹, Калабрія¹, Л Руділоссо¹, П Галліна¹, Г Спіноцці¹, А Маньяні², М Пузольєс³, Ф Фумагаллі¹, В. Калбі¹, М. Вітцель⁴, Ф. Д. Бушман⁵, Канторе¹, Н Тейлор³, В. С. Циммерман³, Клейн⁴, Фішер², М Каваццана², E Шість², А Аіуті¹, Л. Налдіні¹, Е Монтіні¹

¹Інститут генної терапії Сан-Рафаеле (HSR-TIGET)

²Лабораторія лімфогематопоезу людини, INSERM, Франція

³Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier, CNRS, Франція

⁴Дитяча лікарня доктора фон Хаунера, LMU, Німеччина

⁵кафедра мікробіології, UPenn, США

Основні точки даних

Отримання IS з безклітинної ДНК, очищеної від рідин організму
Характеристика профілю інтеграції лентивірусу (LV) у гемофільних собак

Отримання IS з безклітинної ДНК, очищеної від рідин організму

Безклітинна ДНК (вкДНК) виділяється в кров із здорових, запалених або хворих клітин твердих органів (наприклад, печінки або тимуса), які зазнають апоптозу або некрозу. Генетичні зміни в очищеній cfDNA, включаючи сайти векторної геномної інтеграції (IS) із трансдуцованих клітин, можна виявити шляхом секвенування сайтів інтеграції рідинної біопсії (LiBIS-seq).

Характеристика профілю інтеграції лентивірусу (LV) у гемофільних собак

Трьом дорослим гемофільним собакам (O21, M57 і O59) було введено одну ін'єкцію ЛШ, що експресують різні версії собачої коагуляції FIX. Для кожної собаки вкДНК очищали із сироватки крові, зібраної в 7–8 різних часових точках, починаючи з 30 до 532 днів після ін’єкції. Цей графік показує приблизний розмір популяції маркованих клітинних клонів, які вносять внесок у спільні IS з часом у собак M57 та O59.